La Facultad de Ciencias Agrarias cuenta con cuatro departamentos. Los mismos tienen a su cargo el desarrollo de actividades de docencia, investigación, extensión y transferencia:
- Departamento de Calidad y Tecnología de Alimentos
- Departamento de Producción Vegetal, Suelos e Ingeniería Rural
- Departamento de Introducción a las Ciencias Agrarias
- Departamento de Producción Animal
- Departamento de Ciencias Sociales
OCA 1603/16– Reglamento Interno de Funciones, Atribuciones y Funcionamiento de los Departamentos de la Facultad de Ciencias Agrarias